Нормальная свежевыпущенная моча содержит лишь небольшое количество микроорганизмов, большая часть которых поступает в неё во время мочеиспускания. Присутствие большого количества микробов — бактериурия указывает на болезненное состояние мочеиспускательного аппарата или, при лихорадочных заболеваниях, на общую инфекцию.

Кроме сапрофитов, с мочой выделяются и патогенные бактерии, среди которых можно назвать возбудителей наиболее опасных и распространённых инфекций, например, сибирской язвы, туберкулёза, паратифов и др. Диагностическое значение имеет лишь открытие в моче туберкулёзной палочки и Согупе-Bacillus Renalis, Который считается одним из многих возбудителей пиэлонеф-рита крупного рогатого скота.