При подозрении на пироплазмидозы и су-ауру готовят тонкие мазки крови. Их делают шлифованным стеклом на обезжиренных наглядных стеклах из первой капли крови, полученной из сосудов уха. При вскрытии свежих трупов животных готовят мазки-отпечатки паренхиматозных органов и мозга. То же самое делают при экспертизе туш вынужденно убитых животных, больных пироплазмидозом и су-ауру. Приготовленные мазки сушат, подписывают простым карандашом или острым предметом по мазку вид животного и дату взятия материала. От каждого животного готовят 3-4 мазка. При отправке на кафедру или в лабораторию рекомендуется завернуть их в бумагу и в сопроводительном документе указать название хозяйства, вид животного, дату взятия мазка, кто его брал и на что нужно исследовать.

При исследовании крупного рогатого скота на трихомоноз берут истечение или смыв из половых органов коров и быков. От коров, у которых произошел аборт, берут плод, плодные оболочки, околоплодные воды и немедленно посылают в лабораторию. Для удлинения переживаемости трихомонад используют среду В. А. Акатова. При постановке диагноза на эймериозы, в лабораторию посылают фекалии, свежие трупы птиц, кроликов, от крупных животных можно отправлять пораженный отдел кишечника.