Фармакологическая методика определения состояния вегетативной нервной системы является довольно сложной и требует соответствующих условий для выполнения. Методика эта к тому же и небезопасна. Методика вегетативных рефлексов проще, но выявление и оценка результатов представляет также известные трудности. Основная причина этих трудностей заключается в том, что часть рефлексов возникает только при участии спинного мозга и не доходит до коры головного мозга. К таким относятся зрачковый рефлекс, рефлекс теплопродукции и теплоотдачи при перемене внешней температуры. Часть рефлексов доходит до коры головного мозга и только после соответствующей обработки выявляется в форме того или иного ответа. Так, раздражение слизистой носа или глаза вызывает слезотечение. Источником возникновения различных рефлексов могут быть висцеральные боли. При сильных болях в каком-нибудь органе брюшной полости отмечается замедление пульса, рефлекс через блуждающий нерв, остановка перистальтики кишечника вследствие раздражения чревного нерва и т. д.

Часть вегетативных рефлексов получается на коже, а часть на внутренних органах (спланхнические рефлексы). Кожные рефлексы в ветеринарной практике не применяются потому, что кожа животных покрыта шерстью, и проследить изменение цвета или образование гусиной кожи не представляется возможным. Наиболее принятыми можно считать спланхнические рефлексы, которые при соблюдении соответствующих условий, учете клинических показателей и критической оценке получаемых результатов дают представление о состоянии вегетативной нервной системы.