Свежая моча домашних животных имеет специфический запах: довольно резкий у лошади и менее интенсивный у жвачных животных. Моча собак имеет интенсивный чесночный запах, а моча кошек и свиней—острый отвратительный запах, который несколько смягчается в том случае, если моча становится водянистой и менее насыщенной.

При патологических процессах запах мочи может изменяться. Так, при катаральном состоянии мочевого пузыря, вследствие аммиачного брожения, свежевыпущенная моча имеет резкий запах аммиака. Кроме цистита, аммиачное брожение отмечается при параличе мочевого пузыря и закупорке уретры. Сильный гнилостный запах является показателем гангренозного воспаления слизистой оболочки мочевого пузыря или распада тканей при раке. Примесь большого количества ацетона придает моче легкий ароматный запах свежих фруктов. Сладковатый запах хлороформа отмечается при аскаридозе телят.

При лечении животных скипидаром моча приобретает запах фиалок. Некоторые лекарственные вещества, выделяясь с мочой, сообщают ей свойственный им запах. К таким веществам относится камфора, эфирные масла и фенол.